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Cancer metastasis database

Annotation category 5

Gene information

Gene ID 6426
Symbol

SRSF1

Synonymous

ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a

Full name

serine/arginine-rich splicing factor 1

Gene description

SR splicing factor 1|alternative-splicing factor 1|pre-mRNA-splicing factor SF2, P33 subunit|splicing factor 2|splicing factor, arginine/serine-rich, 30-KD, A

Cytoband

17q22

Gene type

protein-coding

Synonymous

MIM:600812; HGNC:HGNC:10780; HPRD:02887

Pathway and disease

Pathways and Diseases

Detail

Pathway

mRNA Splicing;PID Reactome;500995

Pathway

mRNA Splicing - Major Pathway;PID Reactome;500866

Pathway

mRNA Processing;Reactome;REACT:1675

Pathway

mRNA Splicing - Minor Pathway;PID Reactome;500656

Pathway

Spliceosome;KEGG PATHWAY;hsa03040

Pathway

Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript;PID Reactome;500928

Pathway

Transcription;Reactome;REACT:1788

Pathway

Gene Expression;Reactome;REACT:71

Pathway

Post-Elongation Processing of the Transcript;Reactome;REACT:78

Pathway

mRNA 3'-end processing;PID Reactome;500105

Pathway

Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region;PID Reactome;500570

Disease

Eye disease;FunDO

Disease

Cancer;FunDO

Sequence Information

Nucleotide Sequence

>6426 : length: 5668
GTTGCGCTCCCGCGCGTGCGTGTTGGGATCGAATCGCTGTTTCCTTCCGCTTCTCTTCCTCTGTCTCCCCCCCATATCCGTGCGCCGAGCTGATAAAGGCGCCATTTTGGAGGGGCCGCG
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ATGAATTTTGTAATTTAAATTGCAAGTAAGTTATATATATGTATTTACCATAAATAGTATTAAAAGATGAGAAACTGTTAGACTGAAGTTCTGTTGTAACATAACCATTATTTCCATCAC
AGTATGAAGACTGCAAACGCAGAAAACAGATTACAGTCTCTTATCCATTTTTTGAAATCCAAAAACTACGAAAACAAAAGATTTTCTGTTGTTGAGCTAATTAAATGTGAACCCTGACCA
GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Protein Sequence

>6426 : length: 248
MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSE
NRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKFRSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPR
HSRSRSRT