| Gene information | Literature | Expression | lncRNA | Mutation | Homolog |
Basic Information | |
|---|---|
Gene ID | 6426 |
Name | SRSF1 |
Synonym | ASF|SF2|SF2p33|SFRS1|SRp30a;serine/arginine-rich splicing factor 1;SRSF1;serine/arginine-rich splicing factor 1 |
Definition | SR splicing factor 1|alternative-splicing factor 1|pre-mRNA-splicing factor SF2, P33 subunit|splicing factor 2|splicing factor, arginine/serine-rich, 30-KD, A |
Position | 17q22 |
Gene Type | protein-coding |
Pathways and Diseases | |
Pathway | mRNA Splicing;PID Reactome;500995 |
Pathway | mRNA Splicing - Major Pathway;PID Reactome;500866 |
Pathway | mRNA Processing;Reactome;REACT:1675 |
Pathway | mRNA Splicing - Minor Pathway;PID Reactome;500656 |
Pathway | Spliceosome;KEGG PATHWAY;hsa03040 |
Pathway | Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript;PID Reactome;500928 |
Pathway | Transcription;Reactome;REACT:1788 |
Pathway | Gene Expression;Reactome;REACT:71 |
Pathway | Post-Elongation Processing of the Transcript;Reactome;REACT:78 |
Pathway | mRNA 3'-end processing;PID Reactome;500105 |
Pathway | Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region;PID Reactome;500570 |
Disease | Eye disease;FunDO |
Disease | Cancer;FunDO |
External Links | |
Links to cell senescence gene database | 6426 |
Links to epithelial mesenchymal transition gene database | 6426 |
Links to ovarian cancer gene database | 6426 |
Links to endometrial cancer gene database | 6426 |
Links to iHOP | 6426 |
Sequence Information | |
Nucleotide Sequence | >6426 : length: 5668 GTTGCGCTCCCGCGCGTGCGTGTTGGGATCGAATCGCTGTTTCCTTCCGCTTCTCTTCCT CTGTCTCCCCCCCATATCCGTGCGCCGAGCTGATAAAGGCGCCATTTTGGAGGGGCCGCG GGAGACGTGGTGCCGCTGCGGGCTCGCTCTGCCGTGCGCTAGGCTTGGTGGGAAGGCCTG TTCTCGAGTCCGCGCTTTTCGTCACCGCCATGTCGGGAGGTGGTGTGATTCGTGGCCCCG CAGGGAACAACGATTGCCGCATCTACGTGGGTAACTTACCTCCAGACATCCGAACCAAGG ACATTGAGGACGTGTTCTACAAATACGGCGCTATCCGCGACATCGACCTCAAGAATCGCC GCGGGGGACCGCCCTTCGCCTTCGTTGAGTTCGAGGACCCGCGAGACGCGGAAGACGCGG TGTATGGTCGCGACGGCTATGATTACGATGGGTACCGTCTGCGGGTGGAGTTTCCTCGAA GCGGCCGTGGAACAGGCCGAGGCGGCGGCGGGGGTGGAGGTGGCGGAGCTCCCCGAGGTC GCTATGGCCCCCCATCCAGGCGGTCTGAAAACAGAGTGGTTGTCTCTGGACTGCCTCCAA GTGGAAGTTGGCAGGATTTAAAGGATCACATGCGTGAAGCAGGTGATGTATGTTATGCTG ATGTTTACCGAGATGGCACTGGTGTCGTGGAGTTTGTACGGAAAGAAGATATGACCTATG CAGTTCGAAAACTGGATAACACTAAGTTTAGATCTCATGAGGTAGGTTATACACGTATTC TTTTCTTTGACCAGAATTGGATACAGTGGTCTTAACAGTGGAATTTCAAGGTAAGGATTC AGGCAAGGTTGTCCAAGTAAATTGCCAGATTTCTGGTTTTAGTTACATTGTATTCATTCA 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Protein Sequence | >6426 : length: 248 MSGGGVIRGPAGNNDCRIYVGNLPPDIRTKDIEDVFYKYGAIRDIDLKNRRGGPPFAFVE FEDPRDAEDAVYGRDGYDYDGYRLRVEFPRSGRGTGRGGGGGGGGGAPRGRYGPPSRRSE NRVVVSGLPPSGSWQDLKDHMREAGDVCYADVYRDGTGVVEFVRKEDMTYAVRKLDNTKF RSHEGETAYIRVKVDGPRSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSYSPRRSRGSPRYSPR HSRSRSRT |