Epithelial-Mesenchymal Transition gene database (dbEMT) Home
dbEMT
dbEMT 2.0
General information | Literature | Expression | lncRNA |Regulation | Mutation | Homolog | Interaction

Basic Information

From Entrez database: 5101

Gene ID

5101

Name

PCDH9

Synonym

-;protocadherin 9;PCDH9;protocadherin 9

Definition

cadherin superfamily protein VR4-11|protocadherin-9

Position

13q21.32

Gene Type

protein-coding

Pathways and Diseases

From KEGG database

Pathway

Wnt signaling pathway;PANTHER;P00057

Pathway

Cadherin signaling pathway;PANTHER;P00012

External Links

Links to Entrez Gene

5101

Links to all GeneRIF Items

5101

Sequence Information

Nucleotide Sequence

>5101 : length: 9901
AGTTCAGAGAGAGGAGAGGGAGAAGGAGAGAGGGGCAGAGGGGAAGGGAGAGAGGGAGAG
CACGCGAGACGGAAAGGAGCGCCTCAGAGTCTCTGAAGCACGCAAGAGATAACCGATTAG
GAATTTTTCGGGCAACTGTCACCCGGATAGCTGTCAGAGAATCATCATCACCGCAACTCT
GACGTTTCCTACAAGAAGTTAGAGACTTAAGCAGTATTGGCATCGGATGGAAATGGTATG
CATGCTGCTGTGGAAAATATCCCTGAGCTGAAGAAGTGCAACTATGTGTTGTGTGTGCTA
AATGCCCAGAAGAACCCAGACCCAGTGGGTAAGAGAGACGAAATGTGGAGAGAATGACTA
ACGACAAATCCGTGAATTTGTTCTCTGGAGTTGCTAATTTGCCAGCCCGAAGCAACACAT
TTTACAAGGAGGAAACATTTTGCTGCTTCTGATTTCTCCCCAAACTGGTGCTACCAGATG
CATGGCTTTCTATGTGTTGGAACAAATCATTCCTAACTGCAGCATACTGGGAAAGGGGAA
AGGTTGAGGCAACTAACCGGCTGTCTCCAAATAAGTGATGAGATATAATGCATCCTCCAG
TCCATGCACGCTTCCTCTTGCAATTTGTGCATCATTCCTCAGTGGAAACCTTTAAACCCT
AAAATCCAGGAAAAGAAAATAAATACATTATCATGGACCTGAGGGATTTTTACCTGTTGG
CTGCTCTGATTGCCTGTTTAAGGCTGGATTCCGCAATAGCTCAAGAACTTATTTACACTA
TTAGAGAGGAATTGCCTGAAAATGTGCCCATAGGAAACATACCAAAGGATCTGAACATTT
CTCACATCAATGCTGCCACAGGGACCAGCGCCAGCCTTGTCTACAGACTGGTTTCTAAAG
CTGGGGATGCCCCTTTGGTGAAAGTTTCCAGCAGCACTGGGGAAATTTTCACAACCTCCA
ACAGAATAGACAGAGAAAAACTCTGTGCTGGCGCCTCATATGCTGAGGAGAATGAGTGTT
TCTTTGAACTTGAGGTGGTGATCCTCCCCAATGATTTCTTCAGGCTGATCAAAATAAAAA
TAATTGTCAAGGATACCAATGATAATGCCCCCATGTTTCCATCTCCTGTCATCAATATTT
CCATTCCAGAAAACACTTTGATCAACAGCCGCTTTCCAATTCCATCAGCAACAGATCCTG
ACACAGGCTTCAATGGTGTACAGCATTATGAATTGTTAAATGGGCAGAGTGTTTTTGGAC
TGGATATCGTGGAAACTCCAGAGGGAGAGAAGTGGCCACAACTGATTGTTCAGCAAAACT
TGGATAGAGAACAGAAAGATACCTATGTGATGAAAATCAAAGTAGAGGATGGAGGCACTC
CACAGAAATCCAGTACGGCCATACTGCAGGTCACAGTAAGTGATGTAAATGACAACAGGC
CAGTGTTTAAAGAGGGTCAAGTGGAGGTGCATATTCCAGAGAATGCTCCCGTAGGTACCT
CTGTAATTCAGCTCCATGCCACTGATGCAGATATAGGCAGTAATGCTGAAATCCGGTACA
TTTTTGGTGCCCAGGTCGCCCCTGCAACCAAAAGACTCTTTGCTTTAAATAATACTACTG
GGCTGATTACAGTTCAGAGGTCCTTAGATAGAGAGGAGACAGCCATTCACAAAGTGACAG
TGCTGGCTAGTGACGGCAGCTCCACTCCTGCTCGAGCAACGGTTACCATCAATGTCACCG
ATGTAAATGATAACCCTCCTAATATAGACCTCAGGTACATTATAAGTCCCATCAATGGCA
CCGTGTATTTATCTGAGAAAGATCCTGTCAATACAAAGATTGCCCTAATTACAGTTTCAG
ATAAGGACACAGATGTGAATGGCAAAGTGATCTGTTTTATTGAAAGAGAGGTCCCATTTC
ATTTGAAGGCGGTATATGACAACCAATATTTGTTAGAGACCTCTTCTTTGTTGGACTATG
AGGGCACCAAAGAATTCAGCTTTAAAATTGTTGCCTCTGATTCTGGGAAGCCCAGTTTAA
ATCAGACTGCCCTGGTAAGGGTTAAGCTTGAGGATGAAAATGACAACCCACCAATTTTCA
ACCAGCCTGTAATTGAGCTGTCAGTTTCTGAAAACAACCGACGTGGGTTATACTTAACAA
CTATTAGTGCCACAGATGAAGACAGTGGGAAAAATGCAGACATTGTTTATCAGCTTGGAC
CGAATGCCTCCTTCTTTGATCTGGACCGAAAAACAGGAGTTTTGACAGCCTCCAGAGTAT
TTGACAGAGAAGAACAAGAACGATTCATTTTTACAGTAACTGCCAGGGACAATGGGACCC
CTCCCCTCCAAAGCCAAGCGGCTGTGATTGTTACTGTTCTGGATGAGAATGACAATAGCC
CCAAGTTTACTCATAATCATTTTCAATTTTTTGTGTCTGAGAATCTGCCAAAGTATAGTA
CTGTGGGGGTAATCACAGTGACAGATGCAGATGCTGGAGAGAATAAAGCTGTGACTCTTT
CCATTCTAAATGACAATGATAATTTTGTGTTGGATCCCTATTCTGGAGTCATAAAGTCAA
ATGTCTCATTTGATAGAGAGCAGCAGAGTTCCTACACTTTTGATGTCAAAGCCACTGATG
GAGGACAACCACCTCGTTCCTCTACTGCAAAAGTAACTATCAACGTCATGGATGTCAATG
ACAACAGCCCAGTTGTCATTTCTCCACCGTCTAATACTTCCTTTAAGTTGGTGCCCCTCT
CAGCCATTCCTGGCTCCGTGGTAGCAGAAGTTTTTGCAGTGGATGTTGACACTGGAATGA
ACGCTGAACTAAAGTATACTATAGTGAGTGGAAACAATAAAGGCTTATTCCGGATTGATC
CAGTAACAGGTAACATTACTCTGGAAGAAAAACCAGCACCTACTGATGTGGGATTGCATC
GTTTGGTGGTCAACATAAGTGACCTGGGGTACCCTAAGTCTTTGCACACGCTTGTGCTTG
TATTCCTTTATGTTAACGACACTGCTGGAAATGCCTCCTATATCTATGACTTGATCCGCA
GGACTATGGAGACCCCGTTGGACAGGAACATAGGGGATAGTAGCCAACCCTATCAAAATG
AGGACTATCTAACCATCATGATTGCCATCATCGCCGGTGCCATGGTGGTCATTGTTGTGA
TCTTCGTCACCGTTCTGGTGCGCTGTCGCCATGCATCAAGGTTCAAAGCAGCTCAGAGGA
GCAAGCAAGGTGCCGAATGGATGTCCCCAAACCAGGAGAACAAGCAAAACAAGAAAAAGA
AAAGAAAGAAAAGGAAGTCTCCCAAAAGCTCTCTTTTGAACTTTGTTACTATCGAAGAGT
CCAAACCCGATGATGCAGTTCATGAACCTATCAATGGGACAATAAGCCTGCCGGCTGAAC
TGGAGGAGCAAAGTATAGGAAGATTTGACTGGGGCCCGGCACCTCCAACAACATTCAAGC
CTAACAGTCCTGACCTGGCCAAGCACTACAAATCTGCTTCTCCACAGCCTGCTTTTCATC
TCAAACCAGACACTCCAGTTTCCGTGAAAAAGCACCACGTGATTCAGGAACTCCCTTTGG
ACAACACCTTTGTTGGGGGTTGTGACACCCTTTCTAAACGCTCTTCCACTAGTTCAGATC
ACTTCAGTGCCTCAGAGTGCAGTTCCCAAGGAGGCTTCAAGACAAAGGGCCCCTTACACA
CCAGACAGTTTCCTTCAAATGGCAAAAGATGAAAAGAGAAAATTATTCCAAAATGTCCCA
AGATAATGTTTGCTGAAGAAGAAAAAACCTGTCCTGATATGCCAAATTCTGCTCCTGGGG
GTTTCCAAATTGACTGCTTCAAGACTTTCACCTTACCTTTTGATCTAAAAAGTCACCTTC
AAATCTCAAGTTTTCAATGACTTTTGAAGGTGTGACTGCAATTATGTTGCAGCTATGGTT
GCTAAAGGGGTTAATTTTTTTTTTAGTCTCTAAACAGGATAGTAGAATATTAAATGTACA
TCAGCTGTGAAGCACATGATCGTTGATAGATTGCAACTAAGCCATATAGGAAGTCTTCTC
TTTGATTTCAAATTATTTTATTGTAATATATTAAATTCGGTACTTAATAGAAAGATTTTT
AGTGTCCGCAGTGGCCAAATACTCTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGCTTGCTGCCT
AATATAACTGATTTAAAAAGAAAAGAATGAATCCATTGTAAATATTCTCTCATCTTAGTA
ATGCATAAGTGATCTGTCATAACTCATTTTAAACTGTGAAATATGCCATATGAAGAGGGA
TTAAGAGGCTGAGAAACTCATATTTCAACCAAATCCAGAATTAGTTTTTCTTAGGTCTAA
TAATTCCTTGTTAATAAAGATTTAAATGCAGCGCTGTCTAATTTATTTCACTGGTGCTTG
TCTGTTGCCACAAAATTTGAATATCGATAATAGCCTGTAGATGGCACTAGGGTATCATGT
CGCTTGTGCTGGCCAGGTGCCAATCCCGCAGTAGCAAGGAGAAGGGGGAGGGAAGGATCA
AGCTGGTAGTACAGCCAAAGATACCTTTTATTTAATGATAGTTGCTCTGGAGCAACTAGC
ATTTAAGTTCATTCGCTTGCTCTTTTGTGATTAGCTCTCAGCACACCAACTTTCTAGGAT
TTCGTAATGCTAGTTCTGTCTTTGTCGATATGGAGTTCACCTATGGTGATGGCCCATCTG
TACTTGTTTATAAATAAGGAACACATAGATTTTAGAAAATCAAGTAAAGCAAAATTAGTT
TGCAGAACAGTATCAACAGTTATCATTGATTAGTCTTTGGAGAATCAAGAGTTTTTATTT
TCTGAGGGTGGGGTGAAGTAGGATGTTTTATTGAAACAGTTTCCCCCTTACCAACTATCA
TTTATTGCTCTGGAAGGACTTAAGGCTTCATGGTAATAAAATATTTATAAGAGTAATTTT
GACAATGAGTCATACAGATACTCCCAGAACATCAAGTATAATACATATTACCATACAACT
AAAATCTCCATTCTTAAAGTAAAATATTAAACAGTAGAGCGTTTTAAAAGTACAAATATT
TACAGCTTAAATACACAGGAAGAAAGGACTTTAATCAGTATAGAATTTTAAAGGAGACTA
TGAGATTATTACATATAAGTCAAAGTTAGAACGACTTAATTTTTGTGTTAACTTTGTTAG
TATTTGAAAAGAGGTTGATGTTTTAAAATTTAAAAAATGTTCAGTCTTAGTAAAGGTTTT
TAAAAGTTAAATAGTTAACTATGATAAGAAAAGTAATTTATGAAACTAAATGAGTTTGAT
TAAAAAGTTGCTCTTAATGAACAGAAAGAAAATTTTTTAAATTATTTACTTCTGTTATGG
TTACTCACAATACACATGGTATTTTATGATATGCATAATTATGTTGAGAAACTAATATGA
CTTAAACTTTTTCATGTAAAATCTGACATTTTCTTTCCAAAGAAATGTACTGATATACTT
CCAGCATCATCTTTTTTTCTGTCTATACGTGGTGATATTAGCATTGATGTATAGATCCAC
TTTTTCTGACCTCCCCAAAAGTTGAACCTATATATAGTGTAGTGACATAAATGTTAAGTG
CATTTCAGCAAAGTATGCAAGAGATCTTTTCTTGAGGCTTAGTCAGTCATAAAAGTCTTT
GTATGATGTAATCTTTCAAATAGGATACTGAGTAATTCTCTAACTGGAACTAAAGTGCGT
TTTAGAAATTTCTTGTGACCATGTGTCACTTTGCAGTTCTCCTATGGGTATTCCAATGTT
CATATGGAACTAGGTAATTCACTCTTATGATAAAGAGCTATTAAAATGGCTTTGCTTACA
CCTTTTAAAAGTTTTCATGCTGAAAAAGAAATAGTGTGATGTTGGAGAAAAGAGATAGAA
GTCGGTGGAGAAGTGGTAGTGATATACAAAGTAATATGTACATTTTTTTGGATAAAAGAA
GCATATTTCCTATGAATGAACGACATCAAATATATACTACTCTTTAAAAATTTGTTTTCA
CTGAACTGTATGATTGCTATCTGCAGATGTTCTAGTTAAGCTAAAAAGTAAAAACTTTTT
TAACTAGTGGCTTTTATATAAAATGTGCTCCTGAAGCTACACAATTTTGAAAGAGTAACA
TTTCTTGCTACAAAAACTTTCAAAGGAATTTATTTAAAAAAATACAATCTGTGAAGATTT
TAGTTGTGTGACGACTATTGCTCACACCATCTTTTCATTTTATGCTATTAATTGATATGT
GGGTAAAATGCAAGATTCTTGGTTAAAAGCTTACCAAACTTAAATTTCACTCATTTATAC
TGTATGTATAACGAAAACATAACGTCTGATGTTTTCATCATGAATTTGTTTGTGGTACAT
CAATTCCTATATTGTCTGATATTTTTCCCCTTGCTGTTTTCCCTTGTGTTAACCTGCAAA
GAACATAGGAAACACTGTAAATCATATTCCTCATTCACTCTATTTTATAAAGCTTTCATG
TGTCACTAAATTTTTCACAGATTATTTCTTACAAATTTTTGGAAGTGCGATTAGCCTTTA
TAGGTTAAGAATTTACTTTTTTTTTTTTGGCAAAAGGTCATGTCTCGGTAATTATTTGTA
AAAAAAAAAAAAACAACAAAGTTTACAGCCAAAAGGTGAAGAGGATGAAAACGACAACAT
TATCCATTCCAACAAGGCTTTAAATGATAAAATTCATTGGTATATTTGCCTAAAAGAAAA
ATGGTCTTGTTGACAGATATTGTTTTAAAATATGATACTGATTCTCCCTGTGGAATGTCT
GGGAATCATTTGGAGCACTACTTAAAACATGGATTGTTGGGTTCTACCCCAGAGGCTCTG
ATTTCGTACCACTGAGGTCAGGACTGAAAATATACATTGCTAACAAGTTCCTAGGTGGTA
CTGATGCTGCTAGTCCAGGGCCCACACTTTGAGAACCACTACCTTAGCATATTGAAACAG
GAAGTGTCAGCCTCTTTCCCTCTCGTATTATCATATCCAGAGAACCTGTTTTTGCACAGC
CCAACTCTCAGCCCACTTATTGACAGCTGTTTTATTGTAGCTGGAGGCTTTACAGTAAGC
TGTTTATTGCTGTTTCCCAACCCAGTTGACAGCATTTAGGGAATTAATTTCTTGGCCCCT
GTGTGGTTTTTTGGGGGTGGGAAGAGGGAAGATAAATGAAAATGTTAAAGTAAAAGAAAT
AGTCACCCATTTACATTTGACAACTTCTTCAAGTAGTAAAACAGTCTGTAAGAGTTGCAC
TAGACATTGGTTCTGGGTAAACTGTCATTTAATTTTCTAAAGGAAATACTCATTTTAGAG
CTTTAAACATCCTGACTTTTCACAATCTAGAGTATTTACTCACATATATTTTTCTATATA
TTGAGGAATGTATACACTGAAAATGTGTATGCGTGCTGTACTTAAGTGTATACATGTATT
TTTACAGTGTAAAGGGAATTTCTTCTATTCCAAACCATTTAGAGATACTATATTACATTT
ATGATTACTTTTCATTTTTGAATAATCTACTACAACCACTACTGAAATGTTATTATGTTA
TGTAAAATGCGGAAGGCAGTCACAGAATTGATATTTAGAACAGCTAGGGAAAAAATGCAA
TTGAAAGTGAAGGGGGCAAATGTTAACTAATGTGAGGCTAACCAAAATCTTTAAGATATT
TTCAATTATTAAATTCTGGAATAGATATATATAGTGACAGTTGAACACAGGTGACAACTG
ATCCCCCAAATGCAAATTGTTTTTAAAATGTTATCGGTTGTGATTTTTATTTCTATGGCT
CTTTGGCTAAGTGCCCTATGGTCATGAAGTCAGTTTTCATACTTATGAGGTAGAAGATAC
CCAGAGCCCTTGGATATTAACACAGATTTTTGAAATGAGGATAGGCCACCCATTCAAACT
GGCTATCTTTCCATTTGGGTTTGTAAGATAAATATTTGACTATTTTTCTTTCCATCTTGA
TATTCCTAAGCTATAAAATTCAAGACGCATTTTGGCCTTCCATTGCTAATAACATTAAGC
AGAATAAAAATGAAAAGTTACTATTGTATTAAACATAGACATGTCTGTTGATTCTTGAAT
ATTTGTTAACGTAGAGAAAATAGTATATGTGGTGACAATATTCTATTCTCTTATTATTTG
TTTTTGTTGCCATTAATTCAAGATATAGAAACAAGGAACATTAATGTTCTCCTTAGTTTC
AGACCAGTCATCCTATGGTGAGACAGGGCAGGCTTTGGTGTCATTGAAATTACTTTGAAA
ATATTGTACTTGTAATAACATGTTACATTCTTATGGTGTAAACATATTCTTATTATTTAA
ATAATTGCAAGCTATCATTTATCTTCTTATGATTTCATACATTAAATTAAAATATGTGAA
ATAGTAAAGTAGAGGGAATTTAGATTTAAGGAAAAGCCTCAAATCTAAAATCAAATTTTC
TCATAATTAACTATGATTTATATTGAACCTTAAGGTTTCATTTTCATATTGATGTGTGTA
AAATATCTATAAATTATACTTATATTATTAGATATGGCATTGTAACGCATCCTTTTTCAT
ATTACTAATTTTACACTACAGTACTGAAGTATGAAAATGACACCTTTAAATCATTTTGTT
TTCTGTAATCTTATTTCCACAACAATTTTTGTTGTCTTATTTAGATTGTTTTTATTTCTA
ATTTTTTTTTTTCGGTTGGGGGAATTCAGAAATCCACCAAATGCTGAACGTTACAGTTGT
AGCCTTGGTCCCACTATACCAGTCTGGGTGTTTACAGGGTTTCAGGGCCAAGTCAGATGT
CTGTATTGCTCTTTTACAATACTTCTCAGTTTGACTTTGTTAAAGGTGAACTCTTAGCTT
GTATATAGTTAAAAACATAACAAAACTGGAAATCCAGTGGATTGTTTACTACTTTGACTT
AAAATCCTTGGTGCAATCTTTCTTTGAATTTAGTTTGGTGTTTTCTTGAAGATAATTCTT
TATTATAACTAGAAATTACTCTCTTAATATTAGTAAATCATTTAATATCTTATATATTTC
ACTGAGTTGGAAAGTACAAATTAGTTAATGCAGATTTTTAAAGGTTTGGCCTTTCTGACA
CTCAACTTCACATTTAATATTTTTTCCACAATTTATTACATATAAGGACCCTAACCATTA
TATCAGATTTATTAAAATATGACTCTAATCACAGGCCAGGTATTAGTGAAAATTTGGAAA
TGCAAGTCAGGAAGAGGCTTATTCTAAAGTTTCATGGAGGCATAAAAGTCAGACTCTTTC
GTAAGTAATAATGCTAATGTCTTATAGACTTTGACATAGTCAGCGACCCCCAAATCTACA
TTATACTACAGAAGTAAAGACAAATGTAAAAATAGGATCTCTCATGTACATAAGGAGATG
TACTCTGTTTTTAAGATTTCATTGGTTGTTATTTAAGAAAACTGTCAAATCTGTCAAACA
TTTCATTTAGAAAGGAACACATGCTTTTTGCCTTTGTTTGATACAAACCTATTGGGCTGT
CAGTCACCAGAAACATAGAACAAAAAAGATTTATTACCATGATTGACATTTTGCTTTTGA
TTTATATTCTTTTCTTCTGTAAGCCAAGACTCATTAAATTTTCAAATTCCTAAATAAGTT
AAACAACTGTCCTTTTTTAACAGTAAAGAGTGATACAGAAATAAACTGGAAAAACAACCC
ATATTTAATCTTTCTCATTCATATTTTTGTCCTATAGACAGTTTGTCTCTGATAGACAAG
AATAGTGGCAGAATCAGTAGAATTTTCTGAGGCATAGCATATAAATATAAGAAATGCAGA
A



')